Скандал с командой Festina 1998 года привёл к тому, что на старт Тур де Франс 1999 не вышли многие гонщики, которые могли претендовать на борьбу за подиум. В межсезонье были предъявлены новые обвинения в употреблении допинга, а во время Джиро 16 гонщиков заставили пройти дополнительные тесты на допинг. Снятие Марко Пантани с итальянской многодневки из-за превышенного уровня гематокрита в то время, когда он шёл на победу и лидировал в генеральной классификации, вызвало гораздо большее потрясение у болельщиков, чем всё дело «Фестины». Марко Пантани, полностью раздавленный этой дисквалификацией, отказался от участия в Тур де Франс. Уже в июне было объявлено, что команда TVM и ещё несколько человек, включая менеджера команды ONCE Маноло Саиса (Manolo Saiz) не будут допущены к старту Большой Петли. Ещё один возможный фаворит Тур де Франс Ян Ульрих сказал, что не будет принимать участия в гонке из-за травмы колена, полученной на Туре Германии. Таким образом, список претендентов на победу возглавил Павел Тонков (победитель Джиро 1996), Алекс Цулле, Фернандо Эскартин и Иван Готти (победитель Джиро 1997 и 1999). Но, как это часто бывает, в топ-лист возможных победителей не попал тот, кто выиграет Тур де Франс 1999 года. Сошедший с Тура 1996 года, пропустивший старты 1997 и 1998, переживший операцию и химеотерапию, победивший болезнь, которая для многих становилась смертным приговором, Лэнс Армстронг вернулся в профессиональный спорт. Но он вернулся совершенно другим, потеряв 7кг веса, что дало возможность показывать в горах хорошие результаты. В 1998 Армстронг выиграл Тур Люксембурга, стал 4-м на Вуэльте и на разделке чемпионата мира. В 1999 он выиграл пролог на Дофине Либере, и лишь доли секунды проиграл Майклу Богерду на Амстел Голд . Армстронг вернулся, но никто, кроме, пожалуй, Мигеля Индурайна, не называл американца кандидатом в победители. Армстронг вернулся в гонки с американской командой U. S. Postal. До болезни он был связан двухлетним контрактом на 2,5 миллиона долларов с французской командой Cofidis. Когда Лэнс Армстронг проходил курс лечения, руководство Cofidis вдруг решило пересмотреть условия контракта, направив прямо в больницу своего представителя Алана Бондю (Alain Bondue). Состояние Армстронга вообще не позволяло вести какие-либо переговоры, но Cofidis это не волновало, они приняли решение выплатить американскому гонщику треть суммы, предусмотренной первоначальным контрактом – около 600 тысяч долларов. «В «Соfidis» меня считали фактически мертвецом. Мой контракт содержал пункт, требующий от меня пройти медицинское освидетельствование. Ясно, что пройти его с положительным результатом я не смогу. Поэтому организация «Cofidis» имела все основания аннулировать договор. Они же предлагали только пересмотреть его, что было, с их точки зрения, щедрым предложением. Часть положений контракта останется, но не все. Если я не соглашусь с новыми условиями, они будут вынуждены организовать медицинское освидетельствование и вообще разорвать контракт», - рассказал Лэнс Армстронг в своей книге «Не только о велоспорте: мое возвращение к жизни».
